В кулинарии тыквенную муку добавляют в соусы, каши, супы, а также используют в пропорции с другими злаками и видами муки для приготовления обогащенной выпечки.
В профилактических и общеукрепляющих целях муку из тыквенных семечек принимают 2 раза в день, растворив 2 ч. л. продукта в 150-200 мл кефира. Длительность курса 3-4 недели. При непереносимости молочных продуктов можно заменить кефир водой.